Le Togo comme d’autres pays du monde fait parfois face à des fléaux préoccupants. En vue de trouver un rempart contre ces inquiétudes, le pays a pensé à la surveillance génomique qui consiste à suivre l’évolution des agents pathogènes et permet  de détecter rapidement l’émergence de nouveaux variants, d’analyser la résistance aux traitements.et d’orienter efficacement les stratégies de santé publique. C’est dans ce sens que ce lundi 03 août, les ministères de la santé, de l’environnement et de l’agriculture ont procédé conjointement au lancement officiel du Plan stratégique national de la surveillance génomique au Togo pour la période 2026-2028.

Après la pandémie de COVID-19 qui a bouleversé le monde à plusieurs niveaux,la génomique des agents pathogènes s’est ainsi imposée comme l’un des piliers de la sécurité sanitaire contemporaine.

Dans le discours du lancement, le secrétaire général du ministère de la santé et de l’hygiène publique, Dr Kokou Wotobé, représentant son ministre de tutelle, a précisé : "Pour le Togo, comme pour de nombreux pays africains, cette expérience a également révélé la nécessité de consolider les capacités nationales de séquençage et d’analyse génomique, afin de réduire notre dépendance à l’égard des laboratoires extérieurs et de garantir une réponse plus rapide, plus autonome et mieux adaptée à nos réalités.Le Togo demeure confronté à des menaces sanitaires multiples : méningite, dengue, choléra, rougeole, fièvre de Lassa, Mpox, grippe aviaire, maladies zoonotiques, infections d’origine alimentaire et résistance aux antimicrobiens"

Le SG a poursuivi : "À ces risques s’ajoutent les effets du changement climatique, la mobilité croissante des personnes et des biens, l’intensification des échanges ainsi que les transformations de nos écosystèmes. Dans un tel contexte, attendre que la menace se manifeste pour agir serait insuffisant. Nous devons désormais voir plus tôt, comprendre plus vite et intervenir plus efficacement. C’est précisément toute l’ambition du plan que nous lançons aujourd’hui."

Notons que le Plan stratégique national de la surveillance génomique est l’aboutissement d’un processus participatif et multisectoriel engagé depuis avril 2025 par les départements ministériels chargés de la Santé, de l’Agriculture et de l’Environnement.

 Examiné et validé les 23 et 24 avril 2025, il a été élaboré  avec l’appui déterminant d’Africa CDC, de l’Organisation mondiale de la Santé, de la Fondation Bill & Melinda Gates ainsi que des autres partenaires. 

Ce document constitue désormais le cadre national de référence pour le développement, la
coordination et la pérennisation de la surveillance génomique des agents pathogènes.Il traduit la volonté du gouvernement de faire de la génomique non pas un instrument réservé à quelques laboratoires spécialisés, mais un véritable outil d’aide à la décision, pleinement intégré au système national togolais de surveillance épidémiologique.

La mise en œuvre de ce plan représente un investissement de plus de deux milliards huit cents millions de francs CFA sur trois ans. Elle reposera sur les ressources nationales ainsi que sur l’accompagnement de nos partenaires, notamment Africa CDC, à travers l’Africa Pathogen Genomics Initiative, la Fondation Bill & Melinda Gates et l’Organisation mondiale de la Santé, dans le cadre du Fonds de lutte contre les pandémies.